看你上面所有的操作都做过，但是没用是吧？
看下grafana上pd的监控，看看关于region的operator有没有生成啊。
我遇到过类似问题，怎么调storelimit，缩短merge时间都不管用，最后切了一下pd的leader就嗖嗖的merge起来了。
你可以试试
可能是奇技淫巧，但是你上面的各种操作都做了，也就只能死马当活马医了，可以一试。
切换leader的命令：
pd-ctl -i
member leader show
#将 leader 从当前成员移走：
>> member leader resign
#将 leader 迁移至指定成员：
>> member leader transfer pd3