挺奇怪的，从你描述的业务上来说似乎 mvcc 不多。我建议可以通过 tikv-ctl 看下你日志中暴露出来的那个不能分裂的大 region 的属性，看下输出的情况实锤下 mvcc 是否过多 https://docs.pingcap.com/zh/tidb/stable/tikv-control#查看-region-属性 。
如果过多的话，可以通过 tikv-ctl 执行下这个 region 的 compaction，https://docs.pingcap.com/zh/tidb/stable/tikv-control#手动-compact-单个-tikv-的数据 ，使用 force 选项。如果 compaction 后，region size 能够下降，https://github.com/tikv/tikv/pull/15284 这个 pr 应该可以起到作用（发现 invalid split key，compaction 该 region）。建议升级到包含这个 pr 的版本。
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